Side 1 av 3 Norges teknisk- fakultet for naturvitenskapelige universitet naturvitenskap og teknologi Institutt for biologi




Дата канвертавання25.04.2016
Памер11.1 Kb.
Side 1 av 3
Norges teknisk- Fakultet for

naturvitenskapelige universitet naturvitenskap og teknologi

Institutt for biologi
Faglig kontaktpersoner under eksamen: Oppgave 1: Kaare Aagaard (73592281)

Oppgave 2: Kjell Ivar Flatberg (73592248)

Oppgave 3: Torbjørn Ekrem (73597812)

Oppgave 4: Bjarte Jordal (73592299)


EKSAMEN I: BI2000, Systematikk/Taksonomi I BOKMÅL
DATO: Mandag 19. desember 2005
Antall timer: 5

Studiepoeng: 7,5

Antall sider: Tillatte hjelpemidler:

Sensurdato: Torsdag 19. januar 2006 Ingen ___________________________________________________________________________


VED SENSUR TELLER OPPGAVE 1 OG 2 20% HVER, MENS OPPGAVE 3 OG 4 TELLER 30% HVER.

Oppgave 1

Definer følgende begrep: nomenklatur, identifikasjon, klassifikasjon, taksonomi, fylogeni og systematikk.



Oppgave 2

I nyeste utgave av Lids ’Norsk flora’ er stortranebær oppført med følgende latinnavn og author:


Oxycoccus palustris Pers. [Vaccinium oxycoccus L., Oxycoccus quadripetalus Braun-Blanq.]
Tilsvarende har småtranebær følgende latinnavn og author:
Oxycoccus microcarpus Turcz. ex Rupr. [Vaccinium microcarpum (Turcz. ex Rupr.) Schmalh. og Vaccinium oxycoccus ssp. microcarpum (Turcz. ex Rupr.) Hook.]


  1. Hva sier disse navnene og authorsiteringene deg?

  2. Hva legger du i navnet Vaccinium oxycoccus L. ssp. oxycoccus?

  3. Hvilke av disse navnene er korrekte i botanisk nomenklatorisk forstand?

Oppgave 3

Du har gjennomført en fylogenetisk analyse av artene A-J med X som utgruppe. Analysen er basert på morfologiske og molekylære karakterer, og kladogrammet i figur 1 er ditt resultat.



  1. Tidligere studier på samme organismegruppe har gitt kladogrammene i figur 2. Hvilke av disse slektskapshypotesene stemmer ikke overens med ditt resultat?

  2. Trærne i figur 2 er alle kladogrammer. Hva er forskjellene på fylogrammer, ultrametriske trær og kladogrammer?



Figur 1


  1. Hvilke metoder (statistiske og andre) kunne du ha brukt for å undersøke hvor robuste de ulike gruppene i treet er? Gi en kort presentasjon av disse metodene, og diskuter hvilke(n) som ville egne seg best for ditt datasett.

  2. Hvilke fordeler har bruk av DNA-sekvenser i fylogentisk analyse? I hvilke tilfeller vil morfologiske karakter være bedre egnet i slektskapsanalyser?

  3. Lag en fullstendig hierarkisk klassifikasjon av artene A-J, og også en klassifikasjon basert på prinsippet om at etterfølgende søstertaksa kan ha samme kategori.



Figur 2

a

b

c

d



Oppgave 4

Mutasjoner er den opprinnelige kilden til karaktervariasjon som vi observerer i form av substitusjoner i en DNA-sekvens datamatrise.




  1. Gi en oversikt over ulike klasser av mutasjoner som er relevante ved fylogenetiske analyser.




  1. Kimura 2-parameter modellen (K2) er en av flere evolusjonære modeller som benyttes i noen typer fylogenetiske analyser. Nevn hvilken type analyser som kan inkludere slike modeller i analysene. Hvilke parameter er inkludert i K2 modellen og hvordan skiller den seg fra en henholdsvis enklere og en mer avanserte modell (velg en av hver)? Diskuter i denne sammenheng hvilke observasjoner av DNA-sekvens evolusjon som ligger til grunn for en implementering av slike modeller i fylogenetisk analyse?




  1. Hvordan velger man den mest optimale evolusjonære modellen?




  1. Hvilken evolusjonær modell ligner mest på uvektet parsimoni analyse?



Lykke til!


База данных защищена авторским правом ©shkola.of.by 2016
звярнуцца да адміністрацыі

    Галоўная старонка