En fylogenetisk studie av endemiska Silene (Caryophyllaceae) på Kanarieöarna




Дата канвертавання15.04.2016
Памер6.64 Kb.
En fylogenetisk studie av endemiska Silene (Caryophyllaceae) på Kanarieöarna.
Magnus Lundberg
På Kanarieöarna finns det 7 olika arter av släktet Silene som är endemiska, dvs de förekommer endast på Kanarieöarna och ingen annanstans i världen. Dessa växter är mycket lika varandra morfologiskt sett och det råder tveksamheter om hur de är besläktade med varandra. Syftet med mitt arbete har varit att söka svar på flera frågor. Hur dessa endemiska Silene är besläktade med varandra? Är de en monofyletisk grupp? Vad skulle deras geografiska ursprung kunna vara? Finns det något mönster som de spridit sig mellan de kanariska öarna? Vilken är deras närmaste släkting eller grupp av släktingar?
Jag har gjort en molekylär studie som baserades på att söka växternas släktskap genom att jämföra deras DNA. Mitt arbete startade med att extrahera torkade växtdelar från respektive art så att jag fick totala mängden DNA, både kloroplast och DNA från cellkärnan i en lösning. Därefter renades lösningen från produkter som jag inte vill ha, t ex cellväggar och andra organeller som finns i cellerna. Den renade lösningen består då till huvuddelen av DNA och gjordes i ordning för en Polymerase Chain Reaction (PCR)-reaktion, vilket innebär att en specifik del av växtens DNA kopieras, så en stor mängd kopior av just denna region genereras. Detta var nödvändigt för att kunna bestämma växtens DNA-sekvens senare. För att kunna göra en PCR-reaktion användes oligonukleotider (”primers”), dvs korta strängar av DNA, vilka fäster på växtens DNA och styr så att rätt område kopieras. Efter PCR gjordes ytterligare en rening för att ta bort överblivna oligonukleotider och resterna från PCR-reaktionen. Därefter följde sekvensering av PCR-produkten vilket innebar att jag fick ut sekvensen av det kopierade området bas för bas. Sekvenserna kontrollerades och korrigerades. Därefter jämkades sekvenserna ihop i en matris som analyserades med hjälp av olika fylogenetiska dataprogram.
Totalt fick jag ut sekvenser för 4 olika områden från växternas DNA. Ett område var kloroplast DNA och heter rps16. De resterande 3 var av nukleärt ursprung. Två av dessa kärn-DNA områden tillhör RNA-polymerasfamiljen och heter RPA2 och RPB2. Den sista heter ITS som står för Internal Transcribed Spacer region.
Mina resultat visar att de endemiska Silene är mycket lika varandra molekylärt och att de är mycket närbesläktade. Det visade sig att de bildar en monofyletisk grupp. Inbördes släktskap av de kanariska endemerna tyder på att S. berthelotiana och S. tamaranae är mycket närbesläktade med S. lagunensis som systerart. De resterande endemerna bildar en oupplöst grupp till dessa 3 arter. Den art som är närmast besläktad med de Kanariska endemerna är backglim, S. nutans, som är mycket vanlig i nästan hela Europa, men som inte återfinns i Medelhavsområdet eller på Kanarieöarna. Mina data indikerar att de kanariska arterna har ett ursprung i tempererade områden av Eurasien, vilket är mycket ovanligt för Kanariska endemer, som ofta har ett ursprung i Afrika eller Medelhavsområdet. Tyvärr har jag inte kunnat dra några slutsatser om hur endemerna skulle ha spridit sig mellan de Kanariska öarna, detta pga. att de visade sig vara så genetiskt lika.

Examensarbete i biologi, 20 p, vt 2005


Institutionen för Biologisk grundutbildning, avdelningen för Systematisk botanik, Uppsala universitet

Handledare: Bengt Oxelman


База данных защищена авторским правом ©shkola.of.by 2016
звярнуцца да адміністрацыі

    Галоўная старонка